Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C4orf17Q53FE4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4orf17Q53FE4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms