Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC38Q502W7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms