Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPRNQ4KMQ1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPRNQ4KMQ1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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