Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP221Q4G0U5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP221Q4G0U5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms