Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UVSSAQ2YD98 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms