Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC57Q2TAC2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC57Q2TAC2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms