Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ISXQ2M1V0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ISXQ2M1V0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms