Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPROQ16827 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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