Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGISQ16647 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGISQ16647 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms