Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF239Q16600 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF239Q16600 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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