Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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