Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPTX1Q15818 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NPTX1Q15818 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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