Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALX1Q15699 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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