Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SF1Q15637 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SF1Q15637 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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