Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms