Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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RYR3Q15413 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RYR3Q15413 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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RYR3Q15413 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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