Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN1Q15223 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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