Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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CCINQ13939 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CCINQ13939 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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CCINQ13939 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
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