Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPSQ13938 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPSQ13938 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms