Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX3Q13761 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX3Q13761 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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