Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALCAMQ13740 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALCAMQ13740 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms