Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTMR3Q13615 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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