Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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