Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDAC1Q13547 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HDAC1Q13547 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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