Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
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PRPF4BQ13523 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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