Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTM1Q13496 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTM1Q13496 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTM1Q13496 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTM1Q13496 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTM1Q13496 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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