Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XRCC4Q13426 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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