Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMS2P3Q13401 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMS2P3Q13401 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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