Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLAMF1Q13291 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLAMF1Q13291 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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