Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NME3Q13232 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NME3Q13232 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NME3Q13232 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NME3Q13232 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms