Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERCC8Q13216 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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