Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPS1Q13098 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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