Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PRDM2Q13029 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
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