Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSTF3Q12996 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CSTF3Q12996 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CSTF3Q12996 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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CSTF3Q12996 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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CSTF3Q12996 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CSTF3Q12996 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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