Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXF1Q12946 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FOXF1Q12946 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXF1Q12946 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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