Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STX4Q12846 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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STX4Q12846 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
STX4Q12846 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STX4Q12846 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
STX4Q12846 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
STX4Q12846 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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STX4Q12846 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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STX4Q12846 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
STX4Q12846 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
STX4Q12846 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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