Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C1Q12789 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF3C1Q12789 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms