Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXO1Q12778 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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FOXO1Q12778 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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FOXO1Q12778 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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