Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 RGL1YPL066W 1440 nt1.41□□□□□ -2.18
TY2B-BQ12491 YMR045CYMR045C 5268 nt1.41□□□□□ -2.18
TY2B-BQ12491 CDA2YLR308W 939 nt1.41□□□□□ -2.18
TY2B-BQ12491 AIM14YGL160W 1713 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YGR117CYGR117C 1431 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 LSM6YDR378C 261 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 SAR1YPL218W 573 nt1.4□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 RPF2YKR081C 1035 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 HTA2YBL003C 399 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YOL134CYOL134C 390 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 PIG2YIL045W 1617 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 PMD1YER132C 5262 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YDL163WYDL163W 303 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 NHP2YDL208W 471 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 OTU2YHL013C 924 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 ARC18YLR370C 537 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 ERP4YOR016C 624 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 MGA1YGR249W 1371 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 DSS1YMR287C 2910 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 AIM18YHR198C 966 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YKR075CYKR075C 924 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YNL011CYNL011C 1335 nt1.38□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 FIG2YCR089W 4830 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YLR050CYLR050C 486 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 PEX12YMR026C 1200 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 TPP1YMR156C 717 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YDR341CYDR341C 1824 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 MSL5YLR116W 1431 nt1.37□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 EFG1YGR271C-A 702 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YHL044WYHL044W 708 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 IME1YJR094C 1083 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 IGO1YNL157W 507 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YFH7YFR007W 1062 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 URA10YMR271C 684 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 DIA1YMR316W 1011 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 SET4YJL105W 1683 nt1.36□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 POM152YMR129W 4014 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YKL100CYKL100C 1764 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 NRG1YDR043C 696 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 MON2YNL297C 4911 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 TFC8YPL007C 1767 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 CGR1YGL029W 363 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 YNL276CYNL276C 396 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 HRT1YOL133W 366 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 NST1YNL091W 3723 nt1.34□□□□□ -2.19
TY2B-BQ12491 AVT2YEL064C 1443 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 RVS161YCR009C 798 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 ARF1YDL192W 546 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YLR076CYLR076C 423 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YNL109WYNL109W 546 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 HSP10YOR020C 321 nt1.34□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YGR283CYGR283C 1026 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 TIM18YOR297C 579 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YSY6YBR162W-A 198 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 AIM4YBR194W 372 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 TRL1YJL087C 2484 nt1.32□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YOR019WYOR019W 2193 nt1.32□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 SLY41YOR307C 1362 nt1.32□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YOR093CYOR093C 4947 nt1.32□□□□□ -2.2
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TY2B-BQ12491 MCM22YJR135C 720 nt1.31□□□□□ -2.2
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TY2B-BQ12491 YOL014WYOL014W 375 nt1.31□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 RKM4YDR257C 1485 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 PBI1YPL272C 1554 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 TSC13YDL015C 933 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 COS1YNL336W 1146 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 COQ10YOL008W 624 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 PEP12YOR036W 867 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 TYE7YOR344C 876 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YBR292CYBR292C 372 nt1.3□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YNL018CYNL018C 1839 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 TGL2YDR058C 981 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 WIP1YDR374W-A 270 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 PNT1YOR266W 1272 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 UTP8YGR128C 2142 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YGR011WYGR011W 327 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YBL081WYBL081W 1107 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 RPS29BYDL061C 171 nt1.28□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.28□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YNL228WYNL228W 777 nt1.28□□□□□ -2.2
TY2B-BQ12491 YVC1YOR087W 2028 nt1.28□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 SYO1YDL063C 1863 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 NCE101YJL205C 162 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 URA5YML106W 681 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 LSM2YBL026W 288 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 EAP1YKL204W 1899 nt1.27□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.26□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 YGL165CYGL165C 579 nt1.26□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 YPR146CYPR146C 330 nt1.26□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 IRC4YDR540C 540 nt1.26□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 SEC21YNL287W 2808 nt1.25□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 ANR2YKL047W 1551 nt1.24□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 SMT3YDR510W 306 nt1.24□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 YDR521WYDR521W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 UTP30YKR060W 825 nt1.24□□□□□ -2.21
TY2B-BQ12491 VMA6YLR447C 1038 nt1.24□□□□□ -2.21
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