Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 MRPL17YNL252C 846 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 YAP7YOL028C 738 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 PEX15YOL044W 1152 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 HRT1YOL133W 366 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 YPR014CYPR014C 330 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 YPR142CYPR142C 564 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 VPS34YLR240W 2628 nt1.78□□□□□ -2.12
PEX11Q12462 AI4Q0065 1671 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 PCK1YKR097W 1650 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 BUD2YKL092C 3315 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 RMD5YDR255C 1266 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YGL024WYGL024W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YMR099CYMR099C 894 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 ESF2YNR054C 951 nt1.77□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YEL1YBL060W 2064 nt1.76□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 ATG9YDL149W 2994 nt1.76□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 MPH1YIR002C 2982 nt1.76□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YDR124WYDR124W 975 nt1.76□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YFR054CYFR054C 579 nt1.76□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 MRP49YKL167C 414 nt1.76□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 REV1YOR346W 2958 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 DSE1YER124C 1722 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 NRG1YDR043C 696 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YER107W-AYER107W-A 321 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YGL039WYGL039W 1047 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 RMP1YLR145W 606 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 IRC21YMR073C 606 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 FMP41YNL168C 780 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 RRP7YCL031C 894 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YMR045CYMR045C 5268 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 IPT1YDR072C 1584 nt1.75□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 UTP5YDR398W 1932 nt1.74□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 CTL1YMR180C 963 nt1.74□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 LDH1YBR204C 1128 nt1.74□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 AGC1YPR021C 2709 nt1.74□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 NOP12YOL041C 1380 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YPS5YGL259W 498 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 POP6YGR030C 477 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 TDA10YGR205W 873 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 ANS1YHR126C 480 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YKR051WYKR051W 1257 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 RIF2YLR453C 1188 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 VTI1YMR197C 654 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 HUA2YOR284W 732 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 GCN2YDR283C 4980 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 PRP6YBR055C 2700 nt1.73□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 TUS1YLR425W 3924 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 TRM82YDR165W 1335 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 PDR8YLR266C 2106 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YDR131CYDR131C 1671 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 ADK1YDR226W 669 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YER189WYER189W 369 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 CKA1YIL035C 1119 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 YML090WYML090W 387 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 GRX7YBR014C 612 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 RTT107YHR154W 3213 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 ARP9YMR033W 1404 nt1.72□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 CFT1YDR301W 4074 nt1.71□□□□□ -2.13
PEX11Q12462 COG3YER157W 2406 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 UBP16YPL072W 1500 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 RRP12YPL012W 3687 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 RUD3YOR216C 1455 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YPD1YDL235C 504 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 SAY1YGR263C 1275 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YHL045WYHL045W 348 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YIL141WYIL141W 390 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 EAF7YNL136W 1278 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 MRPL40YPL173W 894 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 TRM7YBR061C 933 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 MAL33YBR297W 1407 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 VPS16YPL045W 2397 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 TRM3YDL112W 4311 nt1.71□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YJR098CYJR098C 1971 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YOR093CYOR093C 4947 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 GLC7YER133W 939 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 KEG1YFR042W 603 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 UBR2YLR024C 5619 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YMR178WYMR178W 825 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YNL234WYNL234W 1281 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 SUT2YPR009W 807 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 ERV15YBR210W 429 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 VPS8YAL002W 3825 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 RTT101YJL047C 2529 nt1.7□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 GPI17YDR434W 1605 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 MGA2YIR033W 3342 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 DYN3YMR299C 939 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 SPP381YBR152W 876 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 IRC10YOL015W 1761 nt1.69□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 ART10YLR392C 1557 nt1.68□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 MET18YIL128W 3099 nt1.68□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 RTP1YMR185W 2946 nt1.68□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 ASI3YNL008C 2031 nt1.68□□□□□ -2.14
PEX11Q12462 YCR108CYCR108C 192 nt1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.7 ms