Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCBP1Q09161 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCBP1Q09161 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCBP1Q09161 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms