Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD300CQ08708 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms