Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDE4CQ08493 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4CQ08493 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms