Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLEQ07864 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLEQ07864 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLEQ07864 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLEQ07864 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLEQ07864 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLEQ07864 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLEQ07864 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms