Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC3A1Q07837 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC3A1Q07837 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms