Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EXOSC9Q06265 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EXOSC9Q06265 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms