Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KDSRQ06136 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDSRQ06136 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms