Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TNP2Q05952 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 821.2 ms