Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPN12Q05209 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPN12Q05209 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms