Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CD164Q04900 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CD164Q04900 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms